兵庫県指定有形文化財
圓教寺が開かれる、その前から。
この山には、祈りの場所があった。
法華堂の南に現存する、最古の遺構。
小さな薬師堂は、この山のさらに古い記憶を今に伝えています。
薬師堂は、「根本堂」「根本中堂」とも呼ばれ、書寫山圓教寺に現存する最古の建物です。薬師如来をまつり、開山・性空上人の創建と伝えられています。しかし、この場所の歴史は、圓教寺の開創よりさらに古く遡る可能性があります。
性空上人が書寫山へ入る以前から、ここにはすでに草堂があったとされ、昭和53年（1978）の解体修理では奈良時代の遺物も発見されました。
千年を超える圓教寺の歴史。その始まりよりもさらに前、この山で営まれていた祈りの痕跡を伝える場所です。
圓教寺に現存する最古の建物
寺記『捃拾集』によれば、薬師堂は延慶元年（1308）11月5日に焼失し、元応元年（1319）12月27日に上棟されたと記されています。
現在の建物も、その様式や建築技法から、この時に再建されたものと考えられています。したがって薬師堂は、現在の圓教寺に残る堂宇のなかで、最も古い遺構となります。
昭和53年（1978）には解体修理が行われ、今日までその姿が守り伝えられています。
小さな堂に残る、中世の建築
薬師堂は、圓教寺の堂宇のなかでは比較的小規模な建物です。しかし、その姿をよく見ると、太い柱や挿肘木（さしひじき）など、鎌倉時代に広まった大仏様（だいぶつよう）の建築手法を見ることができます。
華やかさを競う建物ではありません。
簡素で力強い構造のなかに、中世の建築技術と、七百年を超えてこの堂を守り伝えてきた時間が刻まれています。
性空上人以前の書寫山へ
薬師堂を特別な存在にしているのは、建物の古さだけではありません。
この場所には、性空上人が入山する以前から草堂があったと伝えられています。さらに、昭和53年（1978）の解体修理では、奈良時代の遺物＊が発見されました。これらのことから、書寫山には圓教寺が開かれる以前から、すでに何らかの信仰の場が存在していた可能性が指摘されています。
康保3年（966）、性空上人によって開かれたと伝わる書寫山圓教寺。その歴史をさらに遡ったところにも、人々がこの山に祈りを寄せた時間があったのかもしれません。
薬師堂は、圓教寺の「始まり」だけでなく、その始まりの向こうにある書寫山の歴史へとつながる場所なのです。
＊兵庫県立考古博物館の研究資料では、この薬師堂資料について、解体修理時に奈良時代～平安時代の遺物が出土し、具体的に「土師器椀16・17」「須恵器椀27」などの資料番号を挙げています。
薬師如来坐像
薬師堂の本尊として伝えられた木造薬師如来坐像は、像高86.2cm、室町時代の作とされています。もともと薬師堂にまつられていた本尊は、天正6年（1578）、羽柴秀吉が書寫山に陣を置いた際、近江国へ持ち去られたと伝えられています。その後、姫路市菅生の寿勝寺から、「菅生（すごう）の薬師」と呼ばれていた薬師如来坐像を迎え、薬師堂の本尊としたと伝わります。
現在、この薬師如来坐像は薬師堂から移され、食堂2階の宝物館に安置されています。